Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62clA2AG10 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62clA2AG10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup62clA2AG10 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup62clA2AG10 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup62clA2AG10 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup62clA2AG10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup62clA2AG10 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms