Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem185aA2AF53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem185aA2AF53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms