Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms