Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf19bA2A7Q9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Rnf19bA2A7Q9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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