Protein–RNA interactions for Protein: A2A580

1700025C18Rik, MCG1027936, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025C18RikA2A580 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700025C18RikA2A580 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700025C18RikA2A580 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms