Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam71e1A1L3C1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms