Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-2A0A140T8N6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms