Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms