Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms