Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms