Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AU041133A0A0J9YVH3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms