Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv2A0A0B4J1G8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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