Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5493S4R2D1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms