Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac6Q9Z2V5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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