Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms