Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd3Q9Z2D8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd3Q9Z2D8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms