Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne2Q9Z238 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms