Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp4Q9Z1N6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms