Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna2d3Q9Z1L5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms