Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek4Q9Z1J2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms