Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Padi3Q9Z184 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Padi3Q9Z184 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Padi3Q9Z184 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Padi3Q9Z184 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Padi3Q9Z184 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Padi3Q9Z184 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms