Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms