Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms