Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slit3Q9WVB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms