Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms