Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul1Q9WTX6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms