Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms