Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clcf1Q9QZM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clcf1Q9QZM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms