Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms