Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmeff2Q9QYM9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmeff2Q9QYM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmeff2Q9QYM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmeff2Q9QYM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmeff2Q9QYM9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmeff2Q9QYM9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms