Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms