Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3a1Q9QX15 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca3a1Q9QX15 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms