Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Homer2Q9QWW1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Homer2Q9QWW1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Homer2Q9QWW1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Homer2Q9QWW1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Homer2Q9QWW1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Homer2Q9QWW1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms