Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdcQ9QW08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms