Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms