Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl2Q9QUK0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms