Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms