Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrfQ9JM73 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms