Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rabgef1Q9JM13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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