Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc4apQ9JLV2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms