Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms