Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrac1Q9JKP8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms