Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms