Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufaf3Q9JKL4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufaf3Q9JKL4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufaf3Q9JKL4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufaf3Q9JKL4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms