Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Akip1Q9JJR5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms