Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc86Q9JJ89 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc86Q9JJ89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms