Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms