Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms