Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brd4Q9ESU6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms