Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms