Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgef4Q9EQZ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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